Nyílt forráskódú Java Library képfeldolgozáshoz

Az ImgLib2 használatának megkezdése

Az ImgLib2 telepítésének legegyszerűbb és ajánlott módja a GitHubon keresztül.

go get -u github.com/imglib/imglib2.git 

Új képek létrehozása Java segítségével

A nyílt forráskódú ImgLib2 Java-könyvtár támogatja egy új kép létrehozását a semmiből, mindössze néhány soros Java kóddal. Az ImgLib2 könyvtár használatával különféle típusú képeket hozhat létre, például egyszerű képeket, 3D-s képeket, ImgFactory-t stb. A meglévő képek képeit is módosíthatja néhány sornyi kóddal.

        public Example1c()
        {
            // create the ImgFactory based on cells (cellsize = 5x5x5...x5) that will
            // instantiate the Img
            final ImgFactory< FloatType > imgFactory = new CellImgFactory<>( new FloatType(), 5 );
            // create an 3d-Img with dimensions 20x30x40 (here cellsize is 5x5x5)Ø
            final Img< FloatType > img1 = imgFactory.create( 20, 30, 40 );
            // create another image with the same size. Note that the input provides the size for the new image as it implements the Interval interface
            final Img< FloatType > img2 = imgFactory.create( img1 );
            // display both (but they are empty)
            ImageJFunctions.show( img1 );
            ImageJFunctions.show( img2 );
        }

Képmásolás Java API-n keresztül

Az ImgLib2 könyvtár tartalmaz egy funkcionalitást a képmásoláshoz Java parancsok használatával. Könnyedén készíthet másolatot a meglévő képről. A feladat elvégzéséhez kurzorokat használhat. Használhatja a másolási módszert is, amely egy általános módszer, és a nagyszerű dolog az, hogy bármilyen típusú típuson működik.

	public DuplicateImage() throws ImgIOException
	{
		// open with SCIFIO as a FloatType
		Img< FloatType > img = IO.openImgs( "DrosophilaWing.tif", new FloatType() ).get( 0 );
		// copy the image, as it is a generic method it also works with FloatType
		Img< FloatType > duplicate = copyImage( img );
		// display the copy
		ImageJFunctions.show( duplicate );
	}
        // Generic, type-agnostic method to create an identical copy of an Img
	public < T extends Type< T > > Img< T > copyImage( final Img< T > input )
	{
		// create a new Image with the same properties
		Img< T > output = input.factory().create( input );
		// create a cursor for both images
		Cursor< T > cursorInput = input.cursor();
		Cursor< T > cursorOutput = output.cursor();
		// iterate over the input
		while ( cursorInput.hasNext())
		{
			// move both cursors forward by one pixel
			cursorInput.fwd();
			cursorOutput.fwd();
			// set the value of this pixel of the output image to the same as the input,
			// every Type supports T.set( T type )
			cursorOutput.get().set( cursorInput.get() );
		}
		// return the copy
		return output;
	}

Képek megtekintése Részben Java-n keresztül

Az ingyenes ImgLib2 könyvtár lehetővé teszi a szoftverfejlesztők számára, hogy néhány soros Java kódon keresztül csak a kép egyes részeit jelenítsék meg az alkalmazásaikban. A nézetek nagyon hatékonyak, és felhasználhatók a képek kiválasztott részeinek megjelenítésére, elforgatott nézet megjelenítésére és néhány egyéb dologra. A nézetek lehetnek RandomAccessible (Véletlenszerű), Interval (intervallum) és ezért iterálhatóvá tehetők.

Ritka adatkezelés

Az ingyenes ImgLib2 könyvtár lehetővé teszi a szoftverfejlesztők számára, hogy ritka adatokkal dolgozzanak Java kód használatával. A könyvtár két interpolációs sémát biztosított a ritka adatok megjelenítésére. A felhasználók a tér minden helyére kiszámolhatnak egy értéket a legközelebbi minta értékének vagy a mintavételi helyhez legközelebbi k legközelebbi szomszédjának interpolált, távolsággal súlyozott értékének visszaadásával.

        // Working with sparse data
	public SparseExample()
	{
		// the interval in which to create random points
		FinalInterval interval = new FinalInterval( new long[] { 375, 200 } );
		// create an IterableRealInterval
		IterableRealInterval< FloatType > realInterval = createRandomPoints( interval, 250 );
		// using nearest neighbor search we will be able to return a value an any position in space
		NearestNeighborSearch< FloatType > search =
			new NearestNeighborSearchOnKDTree<>(
				new KDTree<>( realInterval ) );
		// make it into RealRandomAccessible using nearest neighbor search
		RealRandomAccessible< FloatType > realRandomAccessible =
			Views.interpolate( search, new NearestNeighborSearchInterpolatorFactory< FloatType >() );
		// convert it into a RandomAccessible which can be displayed
		RandomAccessible< FloatType > randomAccessible = Views.raster( realRandomAccessible );
		// set the initial interval as area to view
		RandomAccessibleInterval< FloatType > view = Views.interval( randomAccessible, interval );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( view );
		// compute a gauss on it
		Img< FloatType > convolved = new ArrayImgFactory<>( new FloatType() ).create( interval );
		Gauss.inFloat( new double[] { 3, 3 }, view, interval, convolved,
			new Point( view.numDimensions() ), convolved.factory() );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( convolved );
	}