Open Source Java knihovna pro zpracování obrazu

Začínáme s ImgLib2

Nejjednodušší a doporučený způsob instalace ImgLib2 je přes GitHub.

go get -u github.com/imglib/imglib2.git 

Vytváření nových obrázků přes Java

Open source Java knihovna ImgLib2 obsahuje podporu pro vytvoření nového obrazu od začátku s pouhými několika řádky kódu Java. Pomocí knihovny ImgLib2 můžete vytvářet různé typy obrázků, jako jsou jednoduché obrázky, 3D obrázky, ImgFactory a další. Můžete také upravit obrázky stávajících obrázků pomocí pouhých několika řádků kódu.

        public Example1c()
        {
            // create the ImgFactory based on cells (cellsize = 5x5x5...x5) that will
            // instantiate the Img
            final ImgFactory< FloatType > imgFactory = new CellImgFactory<>( new FloatType(), 5 );
            // create an 3d-Img with dimensions 20x30x40 (here cellsize is 5x5x5)Ø
            final Img< FloatType > img1 = imgFactory.create( 20, 30, 40 );
            // create another image with the same size. Note that the input provides the size for the new image as it implements the Interval interface
            final Img< FloatType > img2 = imgFactory.create( img1 );
            // display both (but they are empty)
            ImageJFunctions.show( img1 );
            ImageJFunctions.show( img2 );
        }

Duplikace obrazu přes Java API

Knihovna ImgLib2 obsahuje funkce pro duplikaci obrazu pomocí příkazů Java. Můžete snadno vytvořit kopii stávajícího obrázku. K dosažení tohoto úkolu můžete použít kurzory. Můžete také použít metodu kopírování, což je obecná metoda a skvělé je, že bude fungovat na jakémkoli typu.

	public DuplicateImage() throws ImgIOException
	{
		// open with SCIFIO as a FloatType
		Img< FloatType > img = IO.openImgs( "DrosophilaWing.tif", new FloatType() ).get( 0 );
		// copy the image, as it is a generic method it also works with FloatType
		Img< FloatType > duplicate = copyImage( img );
		// display the copy
		ImageJFunctions.show( duplicate );
	}
        // Generic, type-agnostic method to create an identical copy of an Img
	public < T extends Type< T > > Img< T > copyImage( final Img< T > input )
	{
		// create a new Image with the same properties
		Img< T > output = input.factory().create( input );
		// create a cursor for both images
		Cursor< T > cursorInput = input.cursor();
		Cursor< T > cursorOutput = output.cursor();
		// iterate over the input
		while ( cursorInput.hasNext())
		{
			// move both cursors forward by one pixel
			cursorInput.fwd();
			cursorOutput.fwd();
			// set the value of this pixel of the output image to the same as the input,
			// every Type supports T.set( T type )
			cursorOutput.get().set( cursorInput.get() );
		}
		// return the copy
		return output;
	}

Zobrazení obrázků Částečně přes Javu

Bezplatná knihovna ImgLib2 umožňuje vývojářům softwaru zobrazit pouze některé části obrazu v jejich aplikacích prostřednictvím několika řádků kódu Java. Pohledy jsou velmi výkonné a můžete je použít k zobrazení vybraných částí obrázků, zobrazení otočeného pohledu a několika dalších věcí. Zobrazení mohou být RandomAccessible, Interval, a proto mohou být iterovatelná.

Správa řídkých dat

Bezplatná knihovna ImgLib2 poskytuje vývojářům softwaru možnost pracovat s řídkými daty pomocí kódu Java. Knihovna poskytla dvě interpolační schémata pro zobrazení řídkých dat. Uživatelé mohou vypočítat hodnotu pro každé místo v prostoru tak, že vrátí hodnotu nejbližšího vzorku nebo interpolovanou, vzdáleností váženou hodnotu k nejbližších sousedů k navzorkovanému umístění.

        // Working with sparse data
	public SparseExample()
	{
		// the interval in which to create random points
		FinalInterval interval = new FinalInterval( new long[] { 375, 200 } );
		// create an IterableRealInterval
		IterableRealInterval< FloatType > realInterval = createRandomPoints( interval, 250 );
		// using nearest neighbor search we will be able to return a value an any position in space
		NearestNeighborSearch< FloatType > search =
			new NearestNeighborSearchOnKDTree<>(
				new KDTree<>( realInterval ) );
		// make it into RealRandomAccessible using nearest neighbor search
		RealRandomAccessible< FloatType > realRandomAccessible =
			Views.interpolate( search, new NearestNeighborSearchInterpolatorFactory< FloatType >() );
		// convert it into a RandomAccessible which can be displayed
		RandomAccessible< FloatType > randomAccessible = Views.raster( realRandomAccessible );
		// set the initial interval as area to view
		RandomAccessibleInterval< FloatType > view = Views.interval( randomAccessible, interval );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( view );
		// compute a gauss on it
		Img< FloatType > convolved = new ArrayImgFactory<>( new FloatType() ).create( interval );
		Gauss.inFloat( new double[] { 3, 3 }, view, interval, convolved,
			new Point( view.numDimensions() ), convolved.factory() );
		// display the view
		ImageJFunctions.show( convolved );
	}